Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxa4P06798 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa4P06798 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa4P06798 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa4P06798 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms