Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06323 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06323 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06323 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06323 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
P06323 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06323 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P06323 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P06323 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P06323 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P06323 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P06323 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P06323 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P06323 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P06323 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P06323 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P06323 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P06323 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P06323 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P06323 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P06323 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P06323 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P06323 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P06323 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P06323 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P06323 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P06323 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P06323 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P06323 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P06323 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P06323 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P06323 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P06323 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P06323 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P06323 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P06323 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P06323 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06323 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06323 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06323 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06323 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P06323 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P06323 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P06323 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P06323 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P06323 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P06323 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P06323 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P06323 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P06323 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P06323 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P06323 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P06323 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P06323 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P06323 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P06323 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P06323 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P06323 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P06323 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P06323 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P06323 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P06323 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
P06323 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P06323 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P06323 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P06323 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P06323 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P06323 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P06323 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P06323 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P06323 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06323 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06323 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P06323 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06323 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06323 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06323 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P06323 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06323 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06323 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06323 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06323 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06323 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06323 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06323 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06323 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06323 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06323 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06323 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P06323 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06323 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06323 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06323 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06323 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P06323 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P06323 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P06323 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P06323 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P06323 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P06323 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms