Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Got1P05201 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Got1P05201 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Got1P05201 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Got1P05201 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Got1P05201 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Got1P05201 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Got1P05201 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Got1P05201 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Got1P05201 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Got1P05201 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Got1P05201 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Got1P05201 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Got1P05201 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Got1P05201 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Got1P05201 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Got1P05201 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Got1P05201 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Got1P05201 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Got1P05201 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Got1P05201 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Got1P05201 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Got1P05201 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Got1P05201 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Got1P05201 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Got1P05201 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Got1P05201 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Got1P05201 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Got1P05201 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Got1P05201 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Got1P05201 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Got1P05201 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Got1P05201 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Got1P05201 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Got1P05201 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Got1P05201 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Got1P05201 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Got1P05201 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Got1P05201 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Got1P05201 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Got1P05201 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Got1P05201 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Got1P05201 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Got1P05201 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Got1P05201 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Got1P05201 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Got1P05201 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Got1P05201 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Got1P05201 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Got1P05201 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Got1P05201 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Got1P05201 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Got1P05201 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Got1P05201 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Got1P05201 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Got1P05201 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Got1P05201 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Got1P05201 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Got1P05201 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Got1P05201 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Got1P05201 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Got1P05201 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Got1P05201 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Got1P05201 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Got1P05201 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Got1P05201 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Got1P05201 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Got1P05201 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Got1P05201 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Got1P05201 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Got1P05201 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Got1P05201 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Got1P05201 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Got1P05201 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Got1P05201 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Got1P05201 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Got1P05201 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Got1P05201 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Got1P05201 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Got1P05201 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Got1P05201 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Got1P05201 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Got1P05201 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Got1P05201 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Got1P05201 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Got1P05201 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Got1P05201 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Got1P05201 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Got1P05201 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Got1P05201 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Got1P05201 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Got1P05201 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Got1P05201 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Got1P05201 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Got1P05201 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Got1P05201 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Got1P05201 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Got1P05201 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Got1P05201 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Got1P05201 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms