Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P04214 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P04214 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P04214 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P04214 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P04214 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P04214 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P04214 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P04214 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P04214 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P04214 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P04214 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
P04214 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P04214 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P04214 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P04214 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P04214 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P04214 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P04214 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P04214 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P04214 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P04214 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P04214 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P04214 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24■■□□□ 1.43
P04214 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P04214 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
P04214 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
P04214 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P04214 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P04214 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P04214 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P04214 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P04214 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
P04214 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
P04214 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
P04214 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
P04214 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
P04214 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P04214 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P04214 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
P04214 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P04214 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P04214 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
P04214 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
P04214 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P04214 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P04214 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
P04214 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P04214 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P04214 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
P04214 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
P04214 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P04214 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P04214 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P04214 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P04214 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P04214 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P04214 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P04214 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P04214 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
P04214 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P04214 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P04214 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P04214 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P04214 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P04214 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P04214 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P04214 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P04214 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P04214 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P04214 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P04214 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P04214 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
P04214 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P04214 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
P04214 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P04214 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P04214 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P04214 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P04214 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P04214 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P04214 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P04214 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P04214 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P04214 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P04214 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
P04214 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P04214 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P04214 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P04214 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P04214 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P04214 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P04214 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P04214 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
P04214 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
P04214 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
P04214 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P04214 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P04214 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P04214 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms