Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P04213 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P04213 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P04213 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P04213 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P04213 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P04213 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P04213 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
P04213 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P04213 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P04213 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P04213 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P04213 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P04213 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P04213 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P04213 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P04213 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
P04213 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
P04213 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P04213 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
P04213 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P04213 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P04213 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P04213 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P04213 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
P04213 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P04213 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P04213 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P04213 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P04213 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P04213 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
P04213 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P04213 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P04213 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P04213 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P04213 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P04213 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P04213 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P04213 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P04213 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P04213 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P04213 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P04213 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
P04213 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P04213 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P04213 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P04213 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
P04213 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P04213 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P04213 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P04213 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P04213 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P04213 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P04213 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P04213 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P04213 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P04213 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P04213 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P04213 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P04213 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P04213 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P04213 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P04213 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P04213 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P04213 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P04213 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P04213 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
P04213 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P04213 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P04213 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P04213 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P04213 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P04213 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P04213 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P04213 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P04213 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P04213 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P04213 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P04213 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P04213 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P04213 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P04213 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P04213 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P04213 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P04213 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P04213 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P04213 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P04213 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P04213 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P04213 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P04213 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P04213 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P04213 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P04213 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P04213 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P04213 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P04213 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P04213 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
P04213 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P04213 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms