Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-Ab1P01921 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-Ab1P01921 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Ab1P01921 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Ab1P01921 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms