Protein–RNA interactions for Protein: P01843

Ig lambda-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01843 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01843 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01843 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01843 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01843 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01843 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01843 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01843 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01843 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01843 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01843 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01843 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01843 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01843 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01843 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01843 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01843 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01843 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01843 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01843 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01843 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01843 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01843 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01843 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01843 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01843 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01843 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01843 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01843 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01843 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01843 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01843 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01843 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01843 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01843 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01843 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01843 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01843 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01843 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01843 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01843 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01843 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01843 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01843 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01843 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01843 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01843 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01843 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01843 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01843 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01843 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01843 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01843 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01843 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01843 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01843 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01843 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01843 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01843 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01843 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01843 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01843 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01843 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01843 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01843 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01843 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01843 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01843 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01843 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01843 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01843 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01843 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01843 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01843 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01843 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01843 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01843 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01843 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01843 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01843 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01843 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01843 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01843 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01843 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01843 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01843 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01843 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01843 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01843 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01843 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01843 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01843 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01843 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01843 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01843 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01843 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01843 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01843 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01843 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01843 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms