Protein–RNA interactions for Protein: P01837

Ig kappa chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01837 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01837 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01837 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01837 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01837 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01837 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01837 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01837 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01837 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01837 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01837 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01837 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01837 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01837 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01837 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01837 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01837 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01837 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01837 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01837 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01837 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01837 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01837 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01837 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01837 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01837 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01837 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01837 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01837 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01837 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01837 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01837 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01837 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01837 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01837 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P01837 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01837 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01837 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01837 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01837 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01837 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01837 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01837 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01837 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01837 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01837 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01837 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01837 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01837 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01837 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01837 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01837 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01837 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01837 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01837 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01837 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01837 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01837 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01837 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01837 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01837 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01837 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01837 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01837 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01837 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01837 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01837 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01837 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01837 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01837 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01837 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01837 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01837 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01837 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01837 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01837 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01837 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01837 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01837 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01837 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01837 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01837 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01837 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01837 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01837 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01837 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01837 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01837 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01837 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01837 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01837 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01837 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01837 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01837 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01837 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01837 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01837 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01837 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01837 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01837 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms