Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01648 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01648 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01648 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01648 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01648 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01648 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01648 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01648 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
P01648 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01648 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01648 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01648 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01648 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01648 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01648 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01648 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01648 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01648 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01648 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01648 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01648 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01648 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01648 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01648 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01648 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
P01648 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01648 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01648 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01648 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01648 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01648 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01648 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01648 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01648 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01648 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01648 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01648 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01648 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01648 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01648 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01648 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01648 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01648 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
P01648 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01648 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01648 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01648 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01648 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01648 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01648 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01648 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01648 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01648 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01648 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01648 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01648 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01648 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01648 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
P01648 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
P01648 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01648 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01648 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01648 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
P01648 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01648 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01648 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01648 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01648 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01648 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01648 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01648 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01648 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
P01648 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
P01648 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
P01648 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01648 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
P01648 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01648 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01648 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01648 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01648 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01648 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01648 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01648 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01648 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01648 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01648 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01648 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01648 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01648 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01648 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01648 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01648 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01648 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01648 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01648 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01648 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01648 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01648 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms