Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccl20O89093 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccl20O89093 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccl20O89093 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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