Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stx8O88983 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stx8O88983 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stx8O88983 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Stx8O88983 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stx8O88983 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stx8O88983 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stx8O88983 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stx8O88983 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stx8O88983 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stx8O88983 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stx8O88983 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stx8O88983 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stx8O88983 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stx8O88983 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stx8O88983 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stx8O88983 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stx8O88983 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stx8O88983 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stx8O88983 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Stx8O88983 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stx8O88983 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stx8O88983 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stx8O88983 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx8O88983 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stx8O88983 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stx8O88983 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms