Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Setdb1O88974 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Setdb1O88974 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Setdb1O88974 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Setdb1O88974 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Setdb1O88974 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Setdb1O88974 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Setdb1O88974 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Setdb1O88974 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Setdb1O88974 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Setdb1O88974 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Setdb1O88974 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Setdb1O88974 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Setdb1O88974 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Setdb1O88974 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Setdb1O88974 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Setdb1O88974 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Setdb1O88974 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Setdb1O88974 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Setdb1O88974 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Setdb1O88974 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Setdb1O88974 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Setdb1O88974 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Setdb1O88974 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Setdb1O88974 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Setdb1O88974 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Setdb1O88974 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Setdb1O88974 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setdb1O88974 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setdb1O88974 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setdb1O88974 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Setdb1O88974 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Setdb1O88974 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Setdb1O88974 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setdb1O88974 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setdb1O88974 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setdb1O88974 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setdb1O88974 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setdb1O88974 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Setdb1O88974 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Setdb1O88974 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Setdb1O88974 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Setdb1O88974 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Setdb1O88974 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Setdb1O88974 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Setdb1O88974 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setdb1O88974 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms