Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Parp2O88554 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Parp2O88554 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Parp2O88554 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Parp2O88554 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Parp2O88554 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Parp2O88554 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Parp2O88554 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Parp2O88554 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Parp2O88554 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Parp2O88554 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Parp2O88554 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Parp2O88554 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Parp2O88554 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Parp2O88554 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.5 ms