Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dync1i1O88485 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Dync1i1O88485 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dync1i1O88485 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dync1i1O88485 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dync1i1O88485 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dync1i1O88485 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dync1i1O88485 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dync1i1O88485 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dync1i1O88485 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dync1i1O88485 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dync1i1O88485 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dync1i1O88485 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dync1i1O88485 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dync1i1O88485 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dync1i1O88485 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dync1i1O88485 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Dync1i1O88485 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dync1i1O88485 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dync1i1O88485 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dync1i1O88485 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dync1i1O88485 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Dync1i1O88485 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dync1i1O88485 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dync1i1O88485 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dync1i1O88485 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dync1i1O88485 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dync1i1O88485 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dync1i1O88485 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dync1i1O88485 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dync1i1O88485 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dync1i1O88485 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms