Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme6O88425 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme6O88425 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme6O88425 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme6O88425 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme6O88425 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme6O88425 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme6O88425 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme6O88425 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme6O88425 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme6O88425 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme6O88425 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme6O88425 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme6O88425 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme6O88425 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme6O88425 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme6O88425 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme6O88425 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme6O88425 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme6O88425 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme6O88425 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme6O88425 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme6O88425 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme6O88425 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme6O88425 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme6O88425 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme6O88425 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme6O88425 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme6O88425 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme6O88425 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme6O88425 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme6O88425 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme6O88425 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme6O88425 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme6O88425 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.9 ms