Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vti1bO88384 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vti1bO88384 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vti1bO88384 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vti1bO88384 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vti1bO88384 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vti1bO88384 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vti1bO88384 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vti1bO88384 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vti1bO88384 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vti1bO88384 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vti1bO88384 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vti1bO88384 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vti1bO88384 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vti1bO88384 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vti1bO88384 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vti1bO88384 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vti1bO88384 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vti1bO88384 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms