Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Hcn4O70507 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hcn4O70507 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hcn4O70507 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Hcn4O70507 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hcn4O70507 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hcn4O70507 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hcn4O70507 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hcn4O70507 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hcn4O70507 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hcn4O70507 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hcn4O70507 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hcn4O70507 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hcn4O70507 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms