Protein–RNA interactions for Protein: O70343

Ppargc1a, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1aO70343 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppargc1aO70343 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppargc1aO70343 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1aO70343 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1aO70343 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1aO70343 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1aO70343 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1aO70343 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1aO70343 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1aO70343 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppargc1aO70343 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppargc1aO70343 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppargc1aO70343 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppargc1aO70343 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1aO70343 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1aO70343 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1aO70343 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1aO70343 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppargc1aO70343 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppargc1aO70343 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppargc1aO70343 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1aO70343 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1aO70343 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1aO70343 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppargc1aO70343 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppargc1aO70343 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppargc1aO70343 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppargc1aO70343 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppargc1aO70343 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppargc1aO70343 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1aO70343 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1aO70343 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppargc1aO70343 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms