Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hmx1O70218 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmx1O70218 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hmx1O70218 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hmx1O70218 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmx1O70218 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms