Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmb5O55234 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Psmb5O55234 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Psmb5O55234 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmb5O55234 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmb5O55234 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmb5O55234 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Psmb5O55234 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmb5O55234 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmb5O55234 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Psmb5O55234 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Psmb5O55234 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmb5O55234 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmb5O55234 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmb5O55234 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Psmb5O55234 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Psmb5O55234 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmb5O55234 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmb5O55234 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Psmb5O55234 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmb5O55234 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmb5O55234 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb5O55234 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb5O55234 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb5O55234 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb5O55234 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Psmb5O55234 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb5O55234 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Psmb5O55234 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb5O55234 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb5O55234 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb5O55234 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb5O55234 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb5O55234 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb5O55234 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psmb5O55234 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb5O55234 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb5O55234 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmb5O55234 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmb5O55234 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms