Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChkbO55229 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChkbO55229 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChkbO55229 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChkbO55229 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChkbO55229 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChkbO55229 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChkbO55229 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChkbO55229 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ChkbO55229 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ChkbO55229 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChkbO55229 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ChkbO55229 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChkbO55229 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChkbO55229 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChkbO55229 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChkbO55229 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChkbO55229 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChkbO55229 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChkbO55229 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChkbO55229 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChkbO55229 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChkbO55229 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChkbO55229 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChkbO55229 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChkbO55229 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChkbO55229 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChkbO55229 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChkbO55229 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChkbO55229 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChkbO55229 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChkbO55229 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ChkbO55229 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.5 ms