Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChadO55226 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ChadO55226 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChadO55226 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChadO55226 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChadO55226 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChadO55226 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChadO55226 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChadO55226 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChadO55226 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChadO55226 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChadO55226 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChadO55226 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChadO55226 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChadO55226 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChadO55226 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChadO55226 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChadO55226 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChadO55226 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChadO55226 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChadO55226 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChadO55226 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChadO55226 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChadO55226 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChadO55226 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChadO55226 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChadO55226 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChadO55226 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ChadO55226 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ChadO55226 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ChadO55226 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ChadO55226 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ChadO55226 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChadO55226 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChadO55226 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChadO55226 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChadO55226 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChadO55226 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChadO55226 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ChadO55226 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChadO55226 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChadO55226 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChadO55226 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChadO55226 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChadO55226 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChadO55226 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChadO55226 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChadO55226 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChadO55226 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChadO55226 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChadO55226 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChadO55226 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ChadO55226 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChadO55226 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChadO55226 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChadO55226 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChadO55226 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChadO55226 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChadO55226 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ChadO55226 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ChadO55226 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ChadO55226 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChadO55226 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChadO55226 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChadO55226 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChadO55226 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChadO55226 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChadO55226 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChadO55226 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChadO55226 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChadO55226 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChadO55226 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChadO55226 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChadO55226 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChadO55226 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChadO55226 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChadO55226 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChadO55226 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChadO55226 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChadO55226 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChadO55226 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChadO55226 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChadO55226 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChadO55226 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChadO55226 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChadO55226 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChadO55226 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChadO55226 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChadO55226 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChadO55226 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChadO55226 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChadO55226 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChadO55226 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChadO55226 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChadO55226 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChadO55226 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChadO55226 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChadO55226 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChadO55226 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChadO55226 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms