Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OtogO55225 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OtogO55225 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OtogO55225 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OtogO55225 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OtogO55225 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OtogO55225 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OtogO55225 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
OtogO55225 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OtogO55225 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OtogO55225 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OtogO55225 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OtogO55225 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OtogO55225 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OtogO55225 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OtogO55225 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtogO55225 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtogO55225 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtogO55225 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtogO55225 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtogO55225 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtogO55225 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtogO55225 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OtogO55225 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OtogO55225 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OtogO55225 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtogO55225 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OtogO55225 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtogO55225 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtogO55225 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtogO55225 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtogO55225 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtogO55225 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtogO55225 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtogO55225 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtogO55225 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtogO55225 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtogO55225 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtogO55225 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtogO55225 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtogO55225 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtogO55225 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtogO55225 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtogO55225 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtogO55225 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtogO55225 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtogO55225 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtogO55225 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtogO55225 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtogO55225 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtogO55225 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtogO55225 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtogO55225 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OtogO55225 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OtogO55225 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OtogO55225 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OtogO55225 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OtogO55225 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OtogO55225 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OtogO55225 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OtogO55225 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OtogO55225 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OtogO55225 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OtogO55225 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OtogO55225 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OtogO55225 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OtogO55225 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OtogO55225 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OtogO55225 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OtogO55225 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OtogO55225 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OtogO55225 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OtogO55225 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OtogO55225 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OtogO55225 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OtogO55225 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OtogO55225 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OtogO55225 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OtogO55225 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OtogO55225 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OtogO55225 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OtogO55225 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OtogO55225 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OtogO55225 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OtogO55225 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OtogO55225 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OtogO55225 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OtogO55225 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OtogO55225 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OtogO55225 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OtogO55225 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
OtogO55225 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OtogO55225 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OtogO55225 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OtogO55225 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OtogO55225 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OtogO55225 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OtogO55225 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OtogO55225 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OtogO55225 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms