Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ldb2O55203 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ldb2O55203 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldb2O55203 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldb2O55203 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldb2O55203 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldb2O55203 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms