Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35aO55142 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl35aO55142 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl35aO55142 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms