Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnk2O54967 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnk2O54967 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnk2O54967 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnk2O54967 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnk2O54967 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnk2O54967 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnk2O54967 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnk2O54967 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnk2O54967 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnk2O54967 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnk2O54967 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnk2O54967 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnk2O54967 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnk2O54967 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnk2O54967 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnk2O54967 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnk2O54967 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnk2O54967 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnk2O54967 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnk2O54967 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnk2O54967 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnk2O54967 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnk2O54967 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.9 ms