Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf12O35738 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf12O35738 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf12O35738 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf12O35738 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf12O35738 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf12O35738 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf12O35738 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf12O35738 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf12O35738 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf12O35738 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf12O35738 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf12O35738 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf12O35738 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf12O35738 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf12O35738 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms