Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Opn1mwO35599 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Opn1mwO35599 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Opn1mwO35599 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Opn1mwO35599 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms