Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppef2O35385 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppef2O35385 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppef2O35385 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppef2O35385 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppef2O35385 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppef2O35385 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppef2O35385 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppef2O35385 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppef2O35385 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppef2O35385 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppef2O35385 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppef2O35385 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppef2O35385 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppef2O35385 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppef2O35385 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppef2O35385 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppef2O35385 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppef2O35385 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppef2O35385 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppef2O35385 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppef2O35385 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppef2O35385 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppef2O35385 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppef2O35385 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms