Protein–RNA interactions for Protein: O19442

H2-M9, Histocompatibility 2, M region locus 9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M9O19442 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-M9O19442 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-M9O19442 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-M9O19442 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-M9O19442 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-M9O19442 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-M9O19442 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-M9O19442 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-M9O19442 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-M9O19442 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-M9O19442 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-M9O19442 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-M9O19442 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-M9O19442 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-M9O19442 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-M9O19442 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-M9O19442 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-M9O19442 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2-M9O19442 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-M9O19442 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-M9O19442 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms