Protein–RNA interactions for Protein: O08848

Trove2, 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trove2O08848 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trove2O08848 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trove2O08848 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trove2O08848 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trove2O08848 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trove2O08848 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trove2O08848 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trove2O08848 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trove2O08848 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trove2O08848 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trove2O08848 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trove2O08848 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trove2O08848 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trove2O08848 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trove2O08848 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trove2O08848 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trove2O08848 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trove2O08848 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trove2O08848 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trove2O08848 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trove2O08848 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trove2O08848 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trove2O08848 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trove2O08848 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trove2O08848 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trove2O08848 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trove2O08848 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trove2O08848 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trove2O08848 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trove2O08848 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trove2O08848 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trove2O08848 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trove2O08848 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trove2O08848 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms