Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dctn1O08788 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Dctn1O08788 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dctn1O08788 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dctn1O08788 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms