Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nfil3O08750 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Nfil3O08750 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nfil3O08750 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nfil3O08750 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nfil3O08750 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nfil3O08750 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nfil3O08750 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nfil3O08750 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nfil3O08750 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nfil3O08750 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nfil3O08750 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Nfil3O08750 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nfil3O08750 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nfil3O08750 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nfil3O08750 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nfil3O08750 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nfil3O08750 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nfil3O08750 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nfil3O08750 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nfil3O08750 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nfil3O08750 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nfil3O08750 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nfil3O08750 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nfil3O08750 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Nfil3O08750 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nfil3O08750 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nfil3O08750 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nfil3O08750 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nfil3O08750 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nfil3O08750 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nfil3O08750 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nfil3O08750 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nfil3O08750 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nfil3O08750 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nfil3O08750 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nfil3O08750 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nfil3O08750 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nfil3O08750 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nfil3O08750 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nfil3O08750 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms