Protein–RNA interactions for Protein: O08739

Ampd3, AMP deaminase 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ampd3O08739 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ampd3O08739 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ampd3O08739 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ampd3O08739 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms