Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CltaO08585 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CltaO08585 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CltaO08585 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CltaO08585 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CltaO08585 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CltaO08585 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CltaO08585 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CltaO08585 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CltaO08585 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CltaO08585 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CltaO08585 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CltaO08585 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CltaO08585 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CltaO08585 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CltaO08585 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CltaO08585 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CltaO08585 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CltaO08585 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CltaO08585 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CltaO08585 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CltaO08585 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CltaO08585 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CltaO08585 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CltaO08585 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CltaO08585 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CltaO08585 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CltaO08585 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CltaO08585 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CltaO08585 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CltaO08585 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CltaO08585 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CltaO08585 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CltaO08585 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CltaO08585 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CltaO08585 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CltaO08585 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CltaO08585 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CltaO08585 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CltaO08585 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CltaO08585 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CltaO08585 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CltaO08585 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CltaO08585 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CltaO08585 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CltaO08585 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CltaO08585 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CltaO08585 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CltaO08585 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CltaO08585 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CltaO08585 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CltaO08585 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CltaO08585 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CltaO08585 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CltaO08585 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CltaO08585 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CltaO08585 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CltaO08585 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CltaO08585 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CltaO08585 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CltaO08585 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CltaO08585 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CltaO08585 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CltaO08585 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CltaO08585 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CltaO08585 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CltaO08585 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CltaO08585 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CltaO08585 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CltaO08585 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CltaO08585 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CltaO08585 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CltaO08585 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CltaO08585 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CltaO08585 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CltaO08585 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CltaO08585 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CltaO08585 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CltaO08585 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CltaO08585 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CltaO08585 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CltaO08585 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CltaO08585 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CltaO08585 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CltaO08585 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CltaO08585 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CltaO08585 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CltaO08585 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CltaO08585 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CltaO08585 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CltaO08585 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CltaO08585 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CltaO08585 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CltaO08585 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CltaO08585 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CltaO08585 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CltaO08585 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CltaO08585 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CltaO08585 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CltaO08585 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms