Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20939L7N243 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20939L7N243 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20939L7N243 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20939L7N243 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20939L7N243 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20939L7N243 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20939L7N243 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20939L7N243 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20939L7N243 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20939L7N243 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20939L7N243 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20939L7N243 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20939L7N243 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20939L7N243 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20939L7N243 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20939L7N243 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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