Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm2035J3QP87 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm2035J3QP87 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm2035J3QP87 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm2035J3QP87 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm2035J3QP87 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 636 ms