Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top6blJ3QMY9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Top6blJ3QMY9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Top6blJ3QMY9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top6blJ3QMY9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms