Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3336J3QMQ6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3336J3QMQ6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3336J3QMQ6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3336J3QMQ6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3336J3QMQ6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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