Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm29394H3BIW7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm29394H3BIW7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm29394H3BIW7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms