Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arfip1G5E8V9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfip1G5E8V9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfip1G5E8V9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arfip1G5E8V9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arfip1G5E8V9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arfip1G5E8V9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arfip1G5E8V9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arfip1G5E8V9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arfip1G5E8V9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arfip1G5E8V9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arfip1G5E8V9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.6 ms