Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
2610008E11RikG3X964 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
2610008E11RikG3X964 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
2610008E11RikG3X964 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
2610008E11RikG3X964 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms