Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zkscan2G3X952 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zkscan2G3X952 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zkscan2G3X952 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Zkscan2G3X952 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zkscan2G3X952 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zkscan2G3X952 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zkscan2G3X952 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zkscan2G3X952 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zkscan2G3X952 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zkscan2G3X952 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Zkscan2G3X952 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zkscan2G3X952 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms