Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx1-1G3UXB3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nkx1-1G3UXB3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nkx1-1G3UXB3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nkx1-1G3UXB3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nkx1-1G3UXB3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nkx1-1G3UXB3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nkx1-1G3UXB3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nkx1-1G3UXB3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nkx1-1G3UXB3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nkx1-1G3UXB3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nkx1-1G3UXB3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nkx1-1G3UXB3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nkx1-1G3UXB3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nkx1-1G3UXB3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nkx1-1G3UXB3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nkx1-1G3UXB3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nkx1-1G3UXB3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nkx1-1G3UXB3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms