Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Farp1F8VPU2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Farp1F8VPU2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Farp1F8VPU2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Farp1F8VPU2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Farp1F8VPU2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Farp1F8VPU2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Farp1F8VPU2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Farp1F8VPU2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Farp1F8VPU2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Farp1F8VPU2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Farp1F8VPU2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Farp1F8VPU2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Farp1F8VPU2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Farp1F8VPU2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Farp1F8VPU2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms