Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
D430041D05RikF6ZGR6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
D430041D05RikF6ZGR6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
D430041D05RikF6ZGR6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
D430041D05RikF6ZGR6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
D430041D05RikF6ZGR6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
D430041D05RikF6ZGR6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
D430041D05RikF6ZGR6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
D430041D05RikF6ZGR6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
D430041D05RikF6ZGR6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
D430041D05RikF6ZGR6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
D430041D05RikF6ZGR6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
D430041D05RikF6ZGR6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
D430041D05RikF6ZGR6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
D430041D05RikF6ZGR6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
D430041D05RikF6ZGR6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
D430041D05RikF6ZGR6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
D430041D05RikF6ZGR6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
D430041D05RikF6ZGR6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
D430041D05RikF6ZGR6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
D430041D05RikF6ZGR6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
D430041D05RikF6ZGR6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
D430041D05RikF6ZGR6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
D430041D05RikF6ZGR6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
D430041D05RikF6ZGR6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
D430041D05RikF6ZGR6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
D430041D05RikF6ZGR6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
D430041D05RikF6ZGR6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
D430041D05RikF6ZGR6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
D430041D05RikF6ZGR6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
D430041D05RikF6ZGR6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
D430041D05RikF6ZGR6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
D430041D05RikF6ZGR6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
D430041D05RikF6ZGR6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
D430041D05RikF6ZGR6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
D430041D05RikF6ZGR6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
D430041D05RikF6ZGR6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
D430041D05RikF6ZGR6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
D430041D05RikF6ZGR6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
D430041D05RikF6ZGR6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
D430041D05RikF6ZGR6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
D430041D05RikF6ZGR6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
D430041D05RikF6ZGR6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
D430041D05RikF6ZGR6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
D430041D05RikF6ZGR6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
D430041D05RikF6ZGR6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
D430041D05RikF6ZGR6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
D430041D05RikF6ZGR6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
D430041D05RikF6ZGR6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
D430041D05RikF6ZGR6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
D430041D05RikF6ZGR6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
D430041D05RikF6ZGR6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
D430041D05RikF6ZGR6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
D430041D05RikF6ZGR6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
D430041D05RikF6ZGR6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
D430041D05RikF6ZGR6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
D430041D05RikF6ZGR6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
D430041D05RikF6ZGR6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
D430041D05RikF6ZGR6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
D430041D05RikF6ZGR6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
D430041D05RikF6ZGR6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
D430041D05RikF6ZGR6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
D430041D05RikF6ZGR6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
D430041D05RikF6ZGR6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
D430041D05RikF6ZGR6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
D430041D05RikF6ZGR6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
D430041D05RikF6ZGR6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
D430041D05RikF6ZGR6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
D430041D05RikF6ZGR6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms