Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod3E9QA62 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod3E9QA62 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod3E9QA62 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod3E9QA62 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod3E9QA62 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod3E9QA62 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod3E9QA62 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod3E9QA62 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmod3E9QA62 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod3E9QA62 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod3E9QA62 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod3E9QA62 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lmod3E9QA62 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lmod3E9QA62 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lmod3E9QA62 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmod3E9QA62 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmod3E9QA62 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmod3E9QA62 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms