Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Urb2E9Q7L1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Urb2E9Q7L1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Urb2E9Q7L1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Urb2E9Q7L1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Urb2E9Q7L1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Urb2E9Q7L1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Urb2E9Q7L1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Urb2E9Q7L1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Urb2E9Q7L1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Urb2E9Q7L1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Urb2E9Q7L1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Urb2E9Q7L1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Urb2E9Q7L1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Urb2E9Q7L1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Urb2E9Q7L1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Urb2E9Q7L1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Urb2E9Q7L1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Urb2E9Q7L1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Urb2E9Q7L1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Urb2E9Q7L1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Urb2E9Q7L1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Urb2E9Q7L1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Urb2E9Q7L1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Urb2E9Q7L1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Urb2E9Q7L1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Urb2E9Q7L1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Urb2E9Q7L1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Urb2E9Q7L1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
Urb2E9Q7L1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Urb2E9Q7L1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Urb2E9Q7L1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Urb2E9Q7L1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Urb2E9Q7L1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Urb2E9Q7L1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Urb2E9Q7L1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Urb2E9Q7L1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Urb2E9Q7L1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Urb2E9Q7L1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Urb2E9Q7L1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Urb2E9Q7L1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Urb2E9Q7L1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Urb2E9Q7L1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Urb2E9Q7L1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Urb2E9Q7L1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Urb2E9Q7L1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Urb2E9Q7L1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Urb2E9Q7L1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Urb2E9Q7L1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Urb2E9Q7L1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Urb2E9Q7L1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Urb2E9Q7L1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Urb2E9Q7L1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Urb2E9Q7L1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Urb2E9Q7L1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Urb2E9Q7L1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Urb2E9Q7L1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Urb2E9Q7L1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Urb2E9Q7L1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Urb2E9Q7L1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Urb2E9Q7L1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Urb2E9Q7L1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Urb2E9Q7L1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Urb2E9Q7L1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Urb2E9Q7L1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Urb2E9Q7L1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Urb2E9Q7L1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Urb2E9Q7L1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Urb2E9Q7L1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Urb2E9Q7L1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Urb2E9Q7L1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Urb2E9Q7L1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Urb2E9Q7L1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Urb2E9Q7L1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Urb2E9Q7L1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Urb2E9Q7L1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Urb2E9Q7L1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Urb2E9Q7L1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Urb2E9Q7L1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Urb2E9Q7L1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Urb2E9Q7L1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Urb2E9Q7L1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Urb2E9Q7L1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Urb2E9Q7L1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Urb2E9Q7L1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Urb2E9Q7L1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Urb2E9Q7L1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Urb2E9Q7L1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Urb2E9Q7L1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Urb2E9Q7L1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Urb2E9Q7L1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Urb2E9Q7L1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Urb2E9Q7L1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Urb2E9Q7L1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Urb2E9Q7L1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Urb2E9Q7L1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Urb2E9Q7L1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Urb2E9Q7L1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Urb2E9Q7L1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Urb2E9Q7L1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms