Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga10E9Q6R1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga10E9Q6R1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga10E9Q6R1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga10E9Q6R1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga10E9Q6R1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga10E9Q6R1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga10E9Q6R1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga10E9Q6R1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga10E9Q6R1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga10E9Q6R1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itga10E9Q6R1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga10E9Q6R1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms