Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpfE9Q3P4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpfE9Q3P4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpfE9Q3P4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpfE9Q3P4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpfE9Q3P4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpfE9Q3P4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpfE9Q3P4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpfE9Q3P4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpfE9Q3P4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpfE9Q3P4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpfE9Q3P4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpfE9Q3P4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpfE9Q3P4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpfE9Q3P4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpfE9Q3P4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpfE9Q3P4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpfE9Q3P4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpfE9Q3P4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpfE9Q3P4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpfE9Q3P4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpfE9Q3P4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpfE9Q3P4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpfE9Q3P4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpfE9Q3P4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpfE9Q3P4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpfE9Q3P4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpfE9Q3P4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CenpfE9Q3P4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpfE9Q3P4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CenpfE9Q3P4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CenpfE9Q3P4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CenpfE9Q3P4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CenpfE9Q3P4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CenpfE9Q3P4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms